有机肥发酵菌剂是有机肥和生物有机肥生产中重要的物质，发酵菌剂的选择是生物有机肥生产的关键，它关系到生产中有机物料发酵的温度、生产过程等，因此，对发酵菌剂进行研究对生物有机肥的生产有重要意义。
不同有机肥发酵菌剂对生物有机肥发酵温度的影响
不同有机肥发酵菌剂下生物有机肥发酵温度变，观测结果表明，单一发酵菌剂处理下温度上升慢达到高的温度，高温持续时间短，利用 人元生物菌剂处理有机肥发酵时间上缩短，而且高温持续的时间较长，更能有效的杀死粪便等废弃原料中的有害物质，不加任何菌剂的对照温度上升的低，高温持续时间也短。说明在发酵过程中，不同的菌剂对温度的影响还是很大的，不加任何菌剂虽然也可以发酵，但发酵温度上升的较慢，达到的高温度也低，且高温持续的时间也短。
不同发酵菌剂对生物有机肥酶活性的影响
试验结果表明，堆肥初期生物菌活性强，单一菌处理次之;不加菌剂的对照低。堆肥过程中，生物菌活性强，堆肥结束后也以不加菌剂的对照为低，说明未加任何菌剂的对照对纤维素的分解能力低，而且不加菌剂的对照转化能力也比较低。

不同发酵菌种对生物有机肥腐殖酸转化的影响
有机肥经过高温发酵，游离腐殖酸数量增加，说明发酵使有机肥的活性提高了。发酵初期，单一菌的速度较慢，人元生物复合菌转化的快，发酵结束后，肥料中的腐殖酸都转化为游离腐殖酸，生物有机肥活性大大提高。
综上所述，人元生物有机肥菌种，含菌量高，性能稳定，所以在生产过程中，注意添加有益微生物菌群是十分有必要的。