有机肥包括除化肥以外一切可作肥料的物质，通常以人畜粪尿、作物秸秆、绿肥为主。有机肥养分全面，肥效持久均衡，既能改善土壤结构，培肥改土，促进土壤养分的释放，又能供应作物养分，特别是对发展有机农业、绿色农业和无公害农业有着重要意义。但是有机肥种类很多，功能不一，在秋种时节施用有机肥也要讲究科学，忌盲目施用。在施用上应注意以下几点：

有机肥分解较慢肥效较迟，在有机肥施用量不是很大的情况下，不容易足作物对营养元素的需要。而化肥养分含量高，肥效迅速，可根据作物需要量的多少，有针对性地补充，但肥效期短。有机肥与化肥配合施用，二者取长补短，发挥各自的优势，可在数量和时间上满足作物对各种营养元素的需要。

有机肥需经过发酵处理许多有机肥带有病菌、虫卵和杂草种子，有些有机肥中有不利于作物生长的有机化合物，所以均应经过加有机肥生产菌剂堆沤发酵、加工处理后才能施用，生粪不能进地。鹤壁市人元生物有机肥发酵剂发酵后的有机肥与同类产品的相比明显的降低了病虫害的发生率。

有机肥的使用禁忌充分腐熟的有机肥不宜与碱性肥料混用，若与碱性肥料混用，会造成氨的挥发，降低有机肥养分含量。有机肥含有较多的有机物，不宜与硝态氮肥混用。