化肥污染是农田施用大量化肥而引起水体、土壤和大气污染的现象。农田施用的任何种类和形态的化肥，都不可能全部被植物吸收利用。化肥利用率，氮为30-60%，磷为2-25%，钾为30-60%。未被植物及时利用的氮化合物，若以不能被土壤胶体吸附的NH4-N的形式存在，就会随下渗的土壤水转移至根系密集层以下而造成污染。可导致河川、湖泊和内海的富营养化;土壤受到污染，物理性质恶化；食品、饲料和饮用水中有毒成分增加。

化肥污染引起的环境问题主要有：

1、土壤受到污染，土壤物理性质恶化。

长期过量而单纯施用化学肥料，会使土壤酸化。

土壤溶液中和土壤微团上有机、无机复合体的铵离子量增加,并代换Ca2+、Mg2+等，使土壤胶体分散，土壤结构破坏，土地板结,并直接影响农业生产成本和作物的产量和质量。

2、河川、湖泊、内海的富营养化。

引起水域富营养化的原因，主要是水中氮、磷的含量增加，使藻类等水生植物生长过多。

3、大气中氮氧化物含量增加。

施用于农田的氮肥，有相当数量直接从土壤表面挥发成 气体，进入大气。还有相当一部分以有机或无机氮形态进入土壤，在土壤微生物作用下会从难溶态、吸附态和水溶态的氮化合物转化成氮和氮氧化物，进入大气。

4、食品、饲料和饮用水中有毒成分增加。

亚硝酸盐的生物毒性比硝酸盐大5～10倍,亚硝酸盐与胺类结合形成的N－亚硝基化合物则是强致癌物质（见N－亚硝基化合物与癌）。使用化肥的地区的井水或河水中氮化合物的含量会增加，甚至超过饮用水标准。施用化肥过多的土壤会使蔬菜和牧草等作物中硝酸盐含量增加。食品和饲料中亚硝酸盐含量过高，曾引起小儿和牲畜中毒事故。

化学肥料中还含有其他一些杂质，如磷矿石中含镉1～100ppm，含铅5～10ppm,这些杂质也可造成环境污染。

为了防止环境污染，应对施用的化学肥料进行控制和管理。

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