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在有机肥的发酵过程中，不同的微生物菌种扮演着各自的角色。这些菌种大致可以分为以下几类：
1、好氧菌：好氧菌是指在有氧气的环境下生存和繁殖的微生物。它们主要负责分解有机物质，产生能量和代谢物。在有机肥的发酵过程中，好氧菌能够分解有机废物，产生二氧化碳和其他有用的气体，如甲烷和二氧化碳。
2、厌氧菌：厌氧菌是指在没有氧气的环境下生存和繁殖的微生物。它们主要负责分解有机物质，产生能量和代谢物。在有机肥的发酵过程中，厌氧菌可以在封闭或半封闭的环境中工作，分解有机废物，产生有用的气体和液体。
3、兼性菌：兼性菌是指既能在有氧环境下生存和繁殖，又能在无氧环境下生存和繁殖的微生物。它们可以在有机肥的发酵过程中，根据环境条件的变化，改变生活习性，进行有氧或无氧的分解。
4、放线菌：放线菌是一类能产生抗生素的微生物，它们在有机肥的发酵过程中，可以产生有益的抗生素，抑制有害菌的生长，防止有机肥的腐败变质。
5、光合菌：光合菌是一类能进行光合作用的微生物，它们在有机肥的发酵过程中，可以吸收太阳能，合成有机物，提高有机肥的质量。
6、乳酸菌：乳酸菌是一类能产生乳酸的微生物，它们在有机肥的发酵过程中，可以产生乳酸，降低有机肥的pH值，抑制有害菌的生长。
7、酵母菌：酵母菌是一类能进行发酵作用的微生物，它们在有机肥的发酵过程中，可以把糖类转化为乙醇和二氧化碳，产生的乙醇可以进一步被酵母菌转化为酒精和二氧化碳，二氧化碳则可以被有机肥中的植物吸收。
8、丛枝菌根真菌：丛枝菌根真菌是一类能分解木质素和纤维素的真菌，它们在有机肥的发酵过程中，可以分解有机废物中的纤维素和木质素，释放出可供植物吸收的氮、磷、钾等元素。
9、青霉：青霉是一类能产生青霉素的微生物，它们在有机肥的发酵过程中，可以产生青霉素，抑制有害菌的生长。
10、木霉：木霉是一类能产生木霉素的微生物，它们在有机肥的发酵过程中，可以产生木霉素，抑制有害菌的生长。
11、根霉：根霉是一类能产生根霉素的微生物，它们在有机肥的发酵过程中，可以产生根霉素，抑制有害菌的生长。
总的来说，不同的菌种在有机肥的发酵过程中发挥着重要的作用，它们共同完成有机废物的分解和转化，形成腐熟的有机肥。选择合适的菌种和菌剂，可以有效地改善有机肥的发酵效果，提高有机肥的质量。
